La recherche en causalit\u00e9 permet d\u2019\u00e9valuer si une corr\u00e9lation statistique entre deux variables, comme une association entre un nouveau traitement et une am\u00e9lioration du pronostic de patients, peut \u00eatre interpr\u00e9t\u00e9e comme un effet causal. Pourquoi ? Parce que seule la cause peut \u00eatre modifi\u00e9e pour agir sur le probl\u00e8me. La m\u00e9thode de r\u00e9f\u00e9rence pour prouver la causalit\u00e9 d’un traitement est l’essai clinique randomis\u00e9. Dans ce type d’\u00e9tude, les patients sont tir\u00e9s au sort pour recevoir le traitement exp\u00e9rimental ou le traitement standard. L\u2019avantage est que les groupes sont comparables (m\u00eame r\u00e9partition d’\u00e2ge, de sexe, de cat\u00e9gorie socioprofessionnelle, etc.). Ainsi, si le groupe exp\u00e9rimental \u00e9volue mieux, on sait que c’est gr\u00e2ce au traitement test\u00e9. Cependant, cette m\u00e9thode n\u2019est pas toujours adapt\u00e9e. Si l’\u00e9chantillon est trop petit (maladies rares, capacit\u00e9s de recrutement de volontaires, etc.), les groupes peuvent \u00eatre non-comparables et les r\u00e9sultats discutables. L’inclusion de nombreux patients est longue, complexe, couteuse, et soul\u00e8ve des enjeux \u00e9thiques : les patients ne choisissent pas leur traitement, cette d\u00e9cision \u00e9tant obtenue par tirage au sort.<\/p>\n
Le projet CAIR propose une solution innovante \u00e0 ces d\u00e9fis. L’id\u00e9e est de combiner les patients internes tir\u00e9s au sort dans l\u2019essai clinique classique avec des donn\u00e9es externes de patients d\u00e9j\u00e0 existantes. Les avantages sont multiples : acc\u00e9l\u00e9rer la recherche, r\u00e9duire les co\u00fbts, et permettre de mettre plus rapidement \u00e0 disposition des traitements pour les patients en soins courants. Mais int\u00e9grer des donn\u00e9es externes \u00e0 un essai n’est pas simple\u00a0: elles n’ont pas les m\u00eames propri\u00e9t\u00e9s de comparabilit\u00e9 que celles issues d’un tirage au sort. C’est l\u00e0 qu’intervient l’expertise en biostatistique du Pr Foucher et de son \u00e9quipe. Le projet CAIR vise \u00e0 d\u00e9velopper et valider de nouvelles m\u00e9thodes statistiques pour que l’ajout de ces donn\u00e9es n’alt\u00e8re pas la validit\u00e9 des r\u00e9sultats. Plus pr\u00e9cis\u00e9ment, il s\u2019agit de construire des mod\u00e8les ou algorithmes pr\u00e9dictifs de l\u2019\u00e9volution des patients recevant le traitement standard \u00e0 partir des donn\u00e9es externes, puis d\u2019augmenter le bras interne des patients recevant le traitement standard par des patients \u00ab\u00a0virtuels\u00a0\u00bb issus de ces mod\u00e8les ou algorithmes.<\/p>\n
Pour ce faire, l’\u00e9quipe travaille dans un premier temps sur des donn\u00e9es simul\u00e9es num\u00e9riquement. Pourquoi\u00a0? Parce qu’en simulant des donn\u00e9es, on conna\u00eet la “v\u00e9rit\u00e9” de l\u2019effet du traitement. Cela permet de tester la fiabilit\u00e9 des nouvelles m\u00e9thodes et de s’assurer que celles-ci se comportent correctement. Pour les applications concr\u00e8tes, sur de vraies donn\u00e9es, l’\u00e9quipe va r\u00e9analyser l\u2019essai clinique PROPHYLOXITIN promu par le CHU de Poitiers. Le Pr Matthieu Boisson en est l\u2019investigateur principal, le Pr Denis Frasca le m\u00e9thodologiste. Cet essai compare deux m\u00e9thodes d’administration d’antibiotiques pour pr\u00e9venir les infections post-chirurgie colorectale\u00a0: l’administration standard par bolus (injection ponctuelle) et une administration continue. Le projet utilisera l’entrep\u00f4t de donn\u00e9es de sant\u00e9 (EDS) du CHU comme source de donn\u00e9es externes du bras bolus. L’objectif est de voir si, en utilisant ces patients virtuels, on aurait pu obtenir les m\u00eames r\u00e9sultats que l’essai original, mais plus rapidement et en incluant moins de patients. Cela pourrait potentiellement acc\u00e9l\u00e9rer la diffusion de traitements innovants.<\/p>\n
Le projet CAIR est un projet collaboratif qui unit l’expertise de plusieurs \u00e9quipes de recherche en France : Poitiers (CIC INSERM 1402) pour l\u2019expertise sur la causalit\u00e9 et les ensembles d\u2019apprentissage pour cr\u00e9er les patients virtuels, Toulouse (Institut de math\u00e9matiques de Toulouse, CNRS) pour l\u2019expertise en apprentissage par renforcement (une autre approche d’apprentissage automatique) et Bordeaux (INRIA-INSERM) pour leurs comp\u00e9tences sur les mod\u00e8les m\u00e9canistiques (mod\u00e8les bas\u00e9s sur des \u00e9quations diff\u00e9rentielles pour pr\u00e9dire la r\u00e9ponse th\u00e9rapeutique \u00e0 partir de biomarqueurs). Cette collaboration interdisciplinaire permettra de comparer diff\u00e9rentes approches pour la cr\u00e9ation des patients virtuels et valider les m\u00e9thodes les plus performantes. Un doctorant en biostatistique dans chaque \u00e9quipe est recrut\u00e9. Avec l\u2019arriv\u00e9e de Matthieu Trotreau au CIC INSERM 1402 du CHU de Poitiers, l\u2019\u00e9quipe compte aujourd\u2019hui quatre doctorants dans cette th\u00e9matique.<\/p>\n
Cette dynamique est soutenue par la direction du CHU de Poitiers et la commission m\u00e9dicale d’\u00e9tablissement, qui misent clairement sur la sant\u00e9 num\u00e9rique et la recherche sur la r\u00e9utilisation de donn\u00e9es. Cette impulsion, notamment gr\u00e2ce \u00e0 des personnalit\u00e9s comme Anne Costa, directrice g\u00e9n\u00e9rale du CHU de Poitiers, et le Pr Pierre Corbi, pr\u00e9sident de la commission m\u00e9dicale d\u2019\u00e9tablissement, est essentielle pour faire progresser ces projets innovants au service des patients.<\/p>\n
En conclusion, le projet CAIR s\u2019inscrit dans l\u2019utilisation de nouvelles approches num\u00e9riques pour la recherche clinique de demain. En combinant les essais cliniques classiques avec des donn\u00e9es de vie r\u00e9elle, il promet de rendre la recherche m\u00e9dicale plus rapide, plus \u00e9thique et plus efficace.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Le projet CAIR, port\u00e9 par le Pr Yohann Foucher, a \u00e9t\u00e9 retenu lors de l’appel \u00e0 projets Inserm Messidor 2024. Ses travaux en causalit\u00e9 visent\u2026","protected":false},"author":12,"featured_media":72403354,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[96],"tags":[],"class_list":["post-72402910","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-non-classifiee"],"acf":[],"yoast_head":"\n