{"id":21472,"date":"2020-04-16T15:55:15","date_gmt":"2020-04-16T13:55:15","guid":{"rendered":"https:\/\/www.chu-poitiers.fr\/?p=21472"},"modified":"2020-04-16T15:55:40","modified_gmt":"2020-04-16T13:55:40","slug":"covid-19-le-laboratoire-de-microbiologie-moleculaire-fait-face-a-laugmentation-de-lactivite","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.chu-poitiers.fr\/en\/covid-19-le-laboratoire-de-microbiologie-moleculaire-fait-face-a-laugmentation-de-lactivite\/","title":{"rendered":"Covid-19 : Le laboratoire de microbiologie mol\u00e9culaire fait face \u00e0 l\u2019augmentation de l\u2019activit\u00e9"},"content":{"rendered":"\n

Au d\u00e9but de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie, les analyses des pr\u00e9l\u00e8vements n\u2019\u00e9taient pas effectu\u00e9s dans le laboratoire du CHU de Poitiers. Pourquoi ?<\/h3>\n

Nous n\u2019\u00e9tions pas d\u00e9positaires de la technique de RT-PCR qui permettait le d\u00e9pistage du covid-19.  Suite \u00e0 l\u2019\u00e9mergence du virus en Chine et \u00e0 sa diffusion sur le continent europ\u00e9en, c\u2019est l\u2019Institut Pasteur de Paris qui, au niveau national, a d\u00e9velopp\u00e9 la technique de d\u00e9pistage. Ils l\u2019ont ensuite diffus\u00e9e aux laboratoires de virologie des CHU fran\u00e7ais afin que nous puissions la mettre en place localement. Depuis fin f\u00e9vrier, toutes les analyses des centres hospitaliers de Poitou-Charentes sont effectu\u00e9es au CHU de Poitiers.<\/p>\n

Comment les techniques d\u2019analyses ont-elles \u00e9volu\u00e9es depuis le d\u00e9but de la crise ?<\/h3>\n

Initialement, nous disposions, comme seule et unique technique d\u2019analyse, de la m\u00e9thode fournie par l\u2019institut Pasteur. Depuis, de nombreux fabricants ont d\u00e9velopp\u00e9 leurs propres trousses. Celles-ci nous permettent de disposer de techniques plus automatis\u00e9es notamment sur les \u00e9tapes d\u2019extraction et d\u2019amplification des acides nucl\u00e9iques. L\u2019automatisation de certaines \u00e9tapes du processus permet de gagner du temps pour pouvoir prendre en charge un plus grand nombre de pr\u00e9l\u00e8vements.<\/p>\n

Votre service est en contact direct avec le virus ? Quelles sont les pr\u00e9cautions prises ?<\/h3>\n

La premi\u00e8re pr\u00e9caution a \u00e9t\u00e9 prise au niveau du kit de pr\u00e9l\u00e8vement. Au d\u00e9but de la crise, nous utilisions un milieu de transport de pr\u00e9l\u00e8vement classique dans lequel le virus restait infectieux. A l\u2019heure actuelle, nous utilisons un milieu de transport \u00e0 bouchon bleu qui permet d\u2019inactiver en quelques minutes le pouvoir infectieux du virus. Nous garantissons ainsi l\u2019innocuit\u00e9 du pr\u00e9l\u00e8vement au cours du transport pour les services de soin et lors son analyse biologique pour les techniciens du laboratoire.<\/p>\n

Au sein de nos locaux, une pi\u00e8ce est enti\u00e8rement d\u00e9di\u00e9e \u00e0 la manipulation des \u00e9chantillons Covid-19 provenant des patients suspects et av\u00e9r\u00e9s. Les techniciennes sont \u00e9quip\u00e9es de tenues de protection ; elles portent une charlotte, un masque chirurgical, une sur-blouse et des gants pour \u00e9voluer dans la pi\u00e8ce. Les \u00e9chantillons sont manipul\u00e9s sous des postes de s\u00e9curit\u00e9 microbiologique pour \u00e9viter tout risque d\u2019a\u00e9rosol dans la pi\u00e8ce technique.<\/p>\n

Quelle est la situation actuelle au sein de votre service ?<\/h3>\n

Nous avons connu la semaine derni\u00e8re des pics \u00e0 plus de 400 pr\u00e9l\u00e8vements par jour. La situation \u00e9pid\u00e9miologique reste n\u00e9anmoins relativement calme avec entre 10 et 20% d\u2019\u00e9chantillons positifs.<\/p>\n

Le laboratoire a d\u00fb s\u2019adapter pour r\u00e9pondre au nombre croissant de pr\u00e9l\u00e8vements \u00e0 analyser. Il est actuellement ouvert de 6h du matin jusqu\u2019\u00e0 la livraison des derniers r\u00e9sultats, entre 22h et 23h. Nous rendons des r\u00e9sultats tout au long de la journ\u00e9e. A partir du moment o\u00f9 le pr\u00e9l\u00e8vement est physiquement entre nos mains, il faut de 5 \u00e0 6 heures pour pouvoir rendre le r\u00e9sultat.<\/p>\n

Comment vos \u00e9quipes vivent-elles cette situation de crise ?<\/strong><\/h3>\n

Elles la vivent bien mais elles ont d\u00fb fournir un gros effort puisque le laboratoire fonctionne 7\/7 jours, sur des plages horaires de 12 \u00e0 14 heures par jour. De sept personnes form\u00e9es en biologie mol\u00e9culaire, nous sommes pass\u00e9s \u00e0 neuf dans un premier temps. Nous venons de \u00ab recruter \u00bb pour la fili\u00e8re COVID des personnels qui viennent d\u2019autres unit\u00e9s du p\u00f4le, d\u2019autres secteurs du laboratoire mais \u00e9galement du personnel qui vient des unit\u00e9s des recherches. Nous aurons ainsi, dans les jours qui viennent, une \u00e9quipe de 16 personnes.<\/p>\n

Quelles le\u00e7ons tirez-vous d\u00e9j\u00e0 de cette crise exceptionnelle ?<\/h3>\n

Le premier enseignement que j\u2019en tire est l\u2019existence d\u2019une tr\u00e8s forte solidarit\u00e9. Nous avons re\u00e7u \u00e9norm\u00e9ment de propositions d\u2019aide que ce soit du personnel du p\u00f4le biologie-pharmacie mais \u00e9galement des personnels de recherche et m\u00eame de personnels de recherche ext\u00e9rieur \u00e0 notre \u00e9tablissement tels que des personnes de la facult\u00e9 des sciences de l\u2019universit\u00e9 de Poitiers. Elles nous ont propos\u00e9 spontan\u00e9ment leur aide.<\/p>\n

Utiliserez-vous les donn\u00e9es recueillies dans le cadre de travaux de recherches ?<\/h3>\n

Il y a un certain nombre de travaux de recherche clinique qui se mettent progressivement en place sur le coronavirus. Il est possible que ces pr\u00e9l\u00e8vements servent par la suite \u00e0 ces diff\u00e9rents projets. Il est encore un peu t\u00f4t pour le dire mais il est certain que nous allons revenir sur certains pr\u00e9l\u00e8vements r\u00e9alis\u00e9s chez les personnes infect\u00e9es de fa\u00e7on \u00e0 mettre, par exemple, en regard, certains biomarqueurs avec la s\u00e9v\u00e9rit\u00e9 de la maladie. Nous souhaitons \u00e9galement mettre en place rapidement une bio-collection de pr\u00e9l\u00e8vements de s\u00e9rum de patients infect\u00e9s de fa\u00e7on \u00e0 pouvoir \u00e9valuer des trousses de diagnostics s\u00e9rologiques. Nous savons que la s\u00e9rologie, la d\u00e9tection des anticorps produits en r\u00e9ponse \u00e0 l\u2019infection, sera n\u00e9cessaire \u00e0 la sortie du confinement. Elle permettra de d\u00e9terminer quelles sont les personnes immunis\u00e9es vis-\u00e0-vis du covid-19.<\/p>\n\n\n\n

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